Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms