Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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