Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms