Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPA3F8WFD2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPA3F8WFD2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms