Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms