Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf172C9J069 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms