Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms