Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms