Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6CA6NDK9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms