Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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