Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEGF11A6BM72 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms