Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms