Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFCAB5A4FU69 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms