Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms