Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms