Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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