Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms