Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NINLQ9Y2I6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms