Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCQ9Y266 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms