Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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USP18Q9UMW8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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