Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI4Q9UM07 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms