Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZMYND8Q9ULU4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms