Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms