Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms