Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms