Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms