Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms