Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms