Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms