Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAE1Q9UBE0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms