Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFIP11Q9UBB9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms