Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms