Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms