Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP1Q9NZI2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP1Q9NZI2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms