Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms