Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms