Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms