Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMBRD1Q9NUN5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms