Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms