Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOMER3Q9NSC5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms