Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6BQ9NRW1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms