Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INCENPQ9NQS7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms