Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F12Q9HCS2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms