Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSPNQ9HAW4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms