Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms