Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRCC1Q9C099 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms