Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF2Q9C093 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms