Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms