Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms