Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms